在《刺客信條》系列的大多數作品中，各個任務之間很少出現互相影響的情況，主線任務和支線任務的聯系也比較弱，雖然之前也不乏家園建設（《刺客信條3》）、恐怖罪案（《刺客信條：梟雄》）這些水準較高的支線任務，但整體上主線和支線可以說是兩個相互區別、幾近獨立的模塊，多少有一種割裂感。

與《起源》相比，這部作品的故事格局更為宏大，主角探尋身世之謎的過程也更加一波三折、撲朔迷離。但很遺憾，可能是為了適應關卡和任務的節奏，這個故事的推進過程顯得非常拖沓。有時候，你要尋找的人明明就近在眼前，擋路的人卻總是能想出一堆瑣碎的雜事讓你辦完之后才肯放行；也有的時候，主線故事已經發展到了生死攸關的緊要關頭，嚴格的任務等級限制則會逼迫你去做其他任務練級之后再繼續來過。雖然劇情節奏割裂拖沓的問題是當下絕大多數開放世界游戲的通病，但《奧德賽》展現得尤其嚴重。

在前作《刺客信條：起源》中，育碧在這方面的設計已經有了一定的改變，游戲中存在不少和主線息息相關的支線任務：例如“夏迪亞的安息”，承接了主線的部分劇情，給這個故事結了尾；再如“重逢”，之后在主線中活躍的塔希拉在這一任務中初次登場；還有“夜幕低垂之時”，聯通了主線劇情和另一條反抗軍支線……

不同于之前的作品，《刺客信條：奧德賽》在主線任務上可以細分為“家庭”、“神教”、“神話”三條任務線。三條任務線各有側重，但又在作為主角的馴鷹人身上收束，形成了一個相互聯系、推動的整體。這種“多軸驅動”的設計的巧妙之處在于，當某一條任務線處在平淡的過渡期的時候，另一條任務線的展開則可以帶來新的“爆點”，再次激起玩家的興奮感。

在本作流程前期，玩家會離開凱法隆尼亞島，隨著“家庭”任務線繼續推進游戲流程；在與“血狼”相見后，“家庭”任務線告一段落；但若玩家在向女祭司“皮提亞”獲取信息之前繼續探索地圖，可以在蛇之谷發現先前已經出場的厄爾皮諾——他正是開啟“神教”任務線的線索！（如果在此處就將厄爾皮諾擊殺，也會影響到之后與女祭司“皮提亞”的對話內容）通過這條線索繼續追蹤，便可以將“神教”任務線挖掘出來。但在這里“巧合”的是，作為秩序神教的關鍵人物的德謨斯恰好又是馴鷹人的親人，兩條任務線就此產生交匯。

到了游戲的后期，秩序神教的成員看似難覓蹤跡，實際上幾乎貫穿了整個游戲的方方面面。最典型的例子就是尋找 “劍魚”了：在“神話”任務線中的任務“米諾陶諾斯與人類”中，馴鷹人最初的目的是尋找米諾陶諾斯，為此需要獲得一套“忒修斯的盔甲”。在當地進行探索的過程中，玩家又會發現有個在暗中操控局勢、壓榨百姓的危險人物——“劍魚”。但隨著調查的深入，我們又能發現他的另一個身份——秩序神教成員。為此收集的一系列線索、達成的一系列任務，對于“神教”和“神話”這兩條任務線都起到了推動作用。

同時，本作也參考了育碧其他游戲的經驗：銘文設計直接參考了《刺客信條：梟雄》的專精系統，神教獵殺網絡源于《幽靈行動：荒野》的BOSS網設計，傳奇動物獵殺借鑒了《孤島驚魂》系列，刺殺增長腎上腺素的設定也與《細胞分裂》系列的處決系統有幾分相似，裝備切換槽位則近似于《全境封鎖》的一鍵換裝。

這些“細枝末節”看似不值一提，在實際的游玩過程中卻明顯提升了游戲體驗。但總體而言，《刺客信條：奧德賽》仍然可以說是育碧近年來在任務設計和小系統優化方面表現優秀的開放世界游戲，值得各位玩家體驗一番。